無菌室是微生物檢測的重要場所與最基本的設施。它是微生物檢測質量保證的重要物質基礎。因此它的設計要按國家標準-2001《潔凈廠房設計規(guī)范》、國家藥品監(jiān)督管理局頒發(fā)的《藥 品檢驗所實驗室質量管理規(guī)范（試行）》中第十八條規(guī)定執(zhí)行。微生物實驗室潔凈室的施工、安裝、驗收應按國家行業(yè)標準JGJ71-1990《潔凈室的施工及驗收規(guī)范》執(zhí)行。對于微生物檢測工作者和使用管理者來講，更大量的工作是進行正常管理到日常的使用。

無菌室規(guī)劃設計基本要求
    無菌室應根據(jù)既經(jīng)濟又科學的原則來設置。其基本要求有以下幾點： 
（1）無菌室應有內、外兩間，內間是無菌室，外間是緩沖室。房間容積不宜過大，以便于空氣滅菌。內間面積2×2.5＝5m2，外間面積1×2＝2m2，高以2.5m以下為宜，都應有天花板。   

（2）內間應當設拉門，以減少空氣的波動，門應設在離工作臺最遠的位置上；外間的門最好也用拉門，要設在距內間最遠的位置上。 
（3）在分隔內間與外間的墻壁或“隔扇”上，應開一個小窗，作接種過程中必要的內外傳遞物品的通道，以減少人員進出內間的次數(shù)，降低污染程度。小窗寬60cm、高40cm、厚30cm，內外都掛對拉的窗扇。 
（4）無菌室容積小而嚴密，使用一段時間后，室內溫度很高，故應設置通氣窗。通氣窗應設在內室進門處的頂棚上（即離工作臺最遠的位置），最好為雙層結構，外層為百葉窗，內層可用抽板式窗扇。通氣窗可在內室使用后、滅菌前開啟，以流通空氣。有條件可安裝恒溫恒濕機。